Bienvenue sur le site de l'unité BIOGER - CPP de l'INRA

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Editorial

Présentation de l'unité

BIOGER - CPP
Les champignons pathogènes sont une des principales contraintes pour la production agricole en France et en Europe, en particulier pour les grandes cultures (céréales, oléagineux, vigne). Le maintien d’une forte production agricole nécessite d'associer différentes méthodes de lutte contre ces agents pathogènes, telles que les traitements fongicides et l’utilisation de variétés résistantes. Actuellement, les traitements phytosanitaires représentent 44% des intrants agricoles et 33% des charges de l’agriculteur (ONIC). Une meilleure gestion de ces méthodes de lutte est nécessaire pour maîtriser les coûts de production et développer une agriculture respectueuse de l’environnement. Le maintien de l’efficacité des méthodes nécessite aussi de tenir compte de l’évolution des populations de ces agents pathogènes face à ces pressions de sélection. Pour atteindre ces objectifs, il faut approfondir nos connaissances de ces agents pathogènes aussi bien au niveau de leurs processus infectieux que de leurs dynamiques évolutives et de leur impact sur la production et la qualité des récoltes.

L’Unité de recherche BIOGER-CPP (BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes) est un pôle d’excellence français en mycologie qui rassemble un grand nombre des chercheurs de cette discipline sur un même site. Une originalité de cette unité de recherche est de développer des approches pluridisciplinaires en phytopathologie (génomique, biologie moléculaire et biochimie, génétique des populations, évolution, épidémiologie, modélisation, diagnostic et taxonomie, méthodes de lutte). Les études sur les maladies fongiques des plantes réalisées à BIOGER à des échelles allant du gène au paysage, permettent de concevoir et de gérer des méthodes de lutte prenant en compte aussi bien les mécanismes des interactions plante pathogène que leur évolution dans différents systèmes de culture.

Les pathosystèmes étudiés impliquent des champignons responsables de maladies importantes des grandes cultures : rouilles (Puccinia spp. - blé), septoriose (Mycosphaerella graminicola - blé), fusariose (Fusarium graminearum / culmorum - blé), phoma (Leptosphaeria maculans - colza) et pourriture grise (Botrytis cinerea – vigne, tomate, fraise).

Partenariat

L’UR BIOGER accueille le laboratoire de Pathologie Végétale d’ARVALIS qui a en charge les projets de recherche et de développement concernant les champignons pathogènes des cultures suivantes : céréales à paille, maïs, sorgho, protéagineux, pommes de terre et fourrages. Ses activités se structurent autour des thématiques suivantes : 1) Le diagnostic des maladies des grandes cultures, avec une activité orientée vers le terrain en support aux ingénieurs régionaux et aux acteurs des filières agricoles confrontés à la reconnaissance des symptômes des pathogènes. 2) La conservation et l’enrichissement d’une collection de souches des différents pathogènes des grandes cultures, dans un cadre de suivi des populations et de production d’inoculum artificiel en vue d’expérimentations. 3) La compréhension de l’épidémiologie des pathogènes des grandes cultures à l’échelle de la plante et du champ. 4) Le développement de méthodes d’identification et de quantification moléculaire des pathogènes des grandes cultures (PCR, qPCR). 5) La communication des connaissances en pathologie végétale vers les acteurs de la filière agricole par des formations, des articles dans des revues francophones spécialisées et des articles scientifiques.
France : Membre du réseau EGER regroupant les laboratoires étudiant l’agro-ecosystème en Ile de France Sud. Membre de Paris PLANTNET regroupant l’ensemble des laboratoires étudiant les plantes en région Ile de France Sud. Membre du Groupement de laboratoires Interactions Biotiques Saclay. Collaboration active avec les laboratoires des départements SPE, GAP, BV et EA de l'INRA sur les maladies fongiques des plantes. Membre du pôle SIVAAE (Sciences et Ingéniérie du Vivant pour l’Agriculture l’Alimentation et l’Environnement) qui regroupe dans un pôle géographique toutes les compétences existantes en formation, recherche et développement dans le domaine des sciences et technologies du vivant. Membre du RMT ELICITRA (Réseau Mixte Technologique) qui vise à comprendre, développer et promouvoir au sein des filières végétales les stratégies de stimulation de défense des plantes. Collaborations avec les sélectionneurs (Club des 5, CETAC, PROMOSOL, Biogemma.), les associations (AFPP Association française de protection des plantes), l’ANSES (agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail)
Instituts techniques : ARVALIS Institut du Végétal (Institut technique des céréales, fourrages, maïs et pommes de terre), CETIOM (Institut technique des oléagineux), CIVC (Comité interprofessionnel des vins de champagne), CNIV (Comité National des Interprofessions des Vins à Appellation d'Origine)
Industriels : Bayer CropScience, Syngenta, BASF, DuPont de Nemours, Certis, Dow
Europe : Rothamsted Research - Royaume-Uni ; PRI (Plant Research International) – Wageningen University, Hollande ; CBS (Centraalbureau voor Schimmelcultures) - Utrecht, Hollande ; MPI (Max Planck Iinstitut) - Marburg, Allemagne ;- University of Kaiserlautern, Allemagne ; University of Torino (AGROINNOVA), Italie ; OEPP (Organisation Européenne et méditerranéenne de Protection des Plantes) ; EPSO (European Plant Science Organisation)
International : University of Melbourne, Australie;Murdoch University, Australie ;Joint Genome Institute, USA ; Broad Institute, USA; University of Agronomy Santiago, Chili

Enseignement


L'UR BIOGER-CPP a une place privilégiée dans l'enseignement de la pathologie végétale et de la protection des cultures aux élèves de l'AgroParisTech dans le cadre des modules d'enseignement de Pathologie Végétale et de Protection des Cultures et du dispositif d'initiation à la recherche des étudiants de première année lors de leur séjour à Grignon. BIOGER-CPP participe aussi à la formation des étudiants de la dominante (DA) « Protection des Plantes et Environnement » co-habilitée entre l'AgroParisTech, Montpellier Supagro et l’Agrocampus Ouest. BIOGER-CPP participe également très activement à la formation en pathologie végétale des étudiants de la spécialité du Master 2 " Sciences du Végétal " de l'université Paris XI co-habilité avec l'AgroParisTech et l’ENS Cachan. BIOGER-CPP est intégré dans les écoles doctorales " ABIES " de l'AgroParisTech et " Sciences du Végétal " de l'université Paris XI. Dans ce contexte, l'UR BIOGER-CPP constitue une structure d'accueil et de référence pour les étudiants intéressés par la protection des cultures et la pathologie végétale en France.
Rédaction : Marc-Henri Lebrun
Date de création : 27 Mars 2007
Mise à jour : 26 Septembre 2011